O Vale de Arán, no qual está integrada a estância de Baqueira-Beret, foi povoada pela primeira vez em tempos pré-históricos, tal como muitos outros pontos dos Pirinéus. Mais tarde, era por aqui que as tropas romanas de César passavam da região agora ocupada por França para a Península Ibérica. No entanto, apenas no século X começam as referências ao lugar.

Em 1175, o Vale de Arán passa a fazer parte da Coroa de Aragão, sob o reinado de Alfonso II. Durante dois ou três séculos, o Vale de Arán esteve em permanente disputa, pertencendo alternadamente a França e ao Reino de Aragão, até que, em 1313, os habitantes do Vale decidiram que o seu escudo era o de Aragão e não o francês. Foi então que Jaime II outorgou uma série de privilégios a esta região, que, em 1415 se uniu aos condados catalães. Baqueira está integrada, tal como foi descrito, no Vale de Arán, o qual pertence à Diocese de Lérida desde o século XVIII.
Em 1810, as suas terras testemunharam parte das invasões napoleónicas, que entraram na Península Ibérica pelo Puerto de Viella. No entanto, na sequência da queda de Napoleão, o Vale foi devolvido à Coroa Espanhola.
Já no século XX, devemos destacar várias mudanças importantes, que transformaram o Vale de Arán, de forma a se tornar naquilo que conhecemos hoje. Em primeiro lugar, o desenvolvimento de infra-estruturas, estradas, túneis e linhas de caminho de ferro, bem como a conversão da região de predominantemente ganadeira e florestal para zona turística.

Foi no decorrer dos anos 60, época durante a qual a Espanha começou a abrir timidamente as suas portas, que um grupo de pessoas do Vale de Arán decidiu fundar a primeira Estância de Ski do município, a Estância de Naut Aran. Tudo isto foi fruto das óptimas condições apresentadas pela neve neste local.
Actualmente, a ideia destas pessoas consiste na Estância de Inverno com maior afluência de público do país, dispondo de mais de 100 km nos quais é possível praticar ski e com importantes projectos de ampliação sobre a mesa.
Historicamente, a sua economia era baseada na criação de gado e na exploração florestal. Contudo, esta situação mudou, sendo actualmente o turismo o seu principal motor de desenvolvimento.
Marcados no tempo ficaram os anos de 1962, ano no qual foi fundada a Estância, e de 1964, quando foi inagurado o primeiro teleférico. Jorge Jordana de Pozas foi o primeiro Presidente de Baqueira.

Relativamente à cultura, há que destacar a arquitectura de Baqueira, como uma arquitectura integrada no Vale de Arán e nos Pirinéus, repleta de choças, cabanas e palheiros. Também os escudos, as casas de pedra e as chaminés são uma referência e um sinal da identidade dos Pirinéus Leridanos. Igualmente, se sairmos do Vale de Arán, muito próximo dele encontramos o Vale de Boí, onde podemos encontrar as colecções românicas mais importantes da Europa, o que lhe valeu a atribuição do título de Património da Humanidade por parte da UNESCO. A comarca da Alta Ribagorza é considerada como o berço da Arte Românica dos Pirinéus Catalães.